针对师生在土壤微生物科学研究工作中微生物多样性数据挖掘不充分问题,实验室于2018年1月19日举办了土壤微生物多样性数据分析培训班,邀请北京诺禾致源生物信息科技有限公司数据分析专家进行专题讲座,实验室师生共有14人参加了培训会。
培训班首先讲解了第二代和第三代测序技术原理以及高通量测序在当前科学研究工作中应用前景,然后采用实验室土壤微生物16S/18S/ITS等扩增子测序结果和土壤环境数据,以互动方式详细讲述了OTU分析和物种注释、构建属水平物种系统发育树、Alpha多样性指数及组间差异分析、Beta多样性指数及组间差异分析、主坐标分析(PCoA,Principal Co-ordinates Analysis)、主成分分析(PCA,Principal Component Analysis)、无度量多维标定法(NMDS,Non-Metric Multi-Dimensional Scaling)、UPGMA(Unweighted Pair-group Method with Arithmetic Mean)聚类树、环境因子关联分析(Spearman 相关性分析和CCA/RDA分析)等数据分析方法,以及图表的生成与信息解读。最后以发表的两篇高水平生态类SCI论文为例,从实验设计入手讲述论文中该采用那些图表完整准确的表述实验结果,并对环境因子对微生物群落结构的影响,或影响样品分布的重要环境驱动因子的数据挖掘提出了建议。
通过举办专题培训班,及时为师生答疑解惑,对提升试验数据挖掘能力,提高科学研究水平,服务我校“西部一流学科”建设具有助推作用。